Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

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Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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EFNB1P98172 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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EFNB1P98172 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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EFNB1P98172 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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EFNB1P98172 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
EFNB1P98172 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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