Protein–RNA interactions for Protein: P84550

SKOR1, SKI family transcriptional corepressor 1, humanhuman

Predictions only

Length 965 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKOR1P84550 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
SKOR1P84550 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms