Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PIP4K2BP78356 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms