Protein–RNA interactions for Protein: P68400

CSNK2A1, Casein kinase II subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2A1P68400 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NUBP2-214ENST00000568706 913 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CSNK2A1P68400 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms