Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SKP1P63208 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SKP1P63208 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SKP1P63208 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms