Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
ABCE1P61221 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms