Protein–RNA interactions for Protein: P59942

MCCD1, Mitochondrial coiled-coil domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCD1P59942 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
MCCD1P59942 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms