Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NUDT4-201ENST00000337179 9753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
LINC01547P58512 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms