Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTBP2P56545 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms