Protein–RNA interactions for Protein: P54707

ATP12A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP12AP54707 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
ATP12AP54707 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP12AP54707 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP12AP54707 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP12AP54707 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
ATP12AP54707 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms