Protein–RNA interactions for Protein: P52790

HK3, Hexokinase-3, humanhuman

Predictions only

Length 923 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HK3P52790 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HK3P52790 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HK3P52790 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HK3P52790 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms