Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
SMARCA4P51532 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
SMARCA4P51532 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms