Protein–RNA interactions for Protein: P40222

TXLNA, Alpha-taxilin, humanhuman

Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXLNAP40222 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TXLNAP40222 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TXLNAP40222 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms