Protein–RNA interactions for Protein: P40205

MYCNOS, N-cym protein, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNOSP40205 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
MYCNOSP40205 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MYCNOSP40205 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MYCNOSP40205 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
MYCNOSP40205 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
MYCNOSP40205 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms