Protein–RNA interactions for Protein: P38571

LIPA, Lysosomal acid lipase/cholesteryl ester hydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPAP38571 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
LIPAP38571 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIPAP38571 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIPAP38571 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIPAP38571 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIPAP38571 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
LIPAP38571 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
LIPAP38571 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
LIPAP38571 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
LIPAP38571 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms