Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GPC1P35052 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms