Protein–RNA interactions for Protein: P31350

RRM2, Ribonucleoside-diphosphate reductase subunit M2, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRM2P31350 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RRM2P31350 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
RRM2P31350 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms