Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HOXA10P31260 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75 ms