Protein–RNA interactions for Protein: P29376

LTK, Leukocyte tyrosine kinase receptor, humanhuman

Predictions only

Length 864 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTKP29376 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
LTKP29376 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC108725.1-201ENST00000495472 409 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
LTKP29376 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 KXD1-204ENST00000595073 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
LTKP29376 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
LTKP29376 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTKP29376 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTKP29376 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
LTKP29376 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTKP29376 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTKP29376 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTKP29376 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTKP29376 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
LTKP29376 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms