Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
GCAP28676 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
GCAP28676 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
GCAP28676 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms