Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PSMB4P28070 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PSMB4P28070 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms