Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
POLR2AP24928 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms