Protein–RNA interactions for Protein: P24347

MMP11, Stromelysin-3, humanhuman

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP11P24347 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
MMP11P24347 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
MMP11P24347 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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