Protein–RNA interactions for Protein: P23368

ME2, NAD-dependent malic enzyme, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME2P23368 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ME2P23368 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ME2P23368 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ME2P23368 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
ME2P23368 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ME2P23368 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms