Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SMARCA2-208ENST00000382194 5679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CDK11BP21127 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CDK11BP21127 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms