Protein–RNA interactions for Protein: P20719

HOXA5, Homeobox protein Hox-A5, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA5P20719 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
HOXA5P20719 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms