Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCNA2P20248 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms