Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
ATP2A2P16615 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ATP2A2P16615 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms