Protein–RNA interactions for Protein: P14653

HOXB1, Homeobox protein Hox-B1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB1P14653 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL391863.1-201ENST00000422776 743 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL591848.2-201ENST00000442712 522 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC114495.2-201ENST00000452686 437 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC021546.1-201ENST00000518927 1031 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 CNIH1-203ENST00000553660 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC007228.2-201ENST00000602145 1328 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HOXB1P14653 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 IFNA14-201ENST00000380222 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL133417.1-201ENST00000425290 688 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL121578.1-201ENST00000428051 892 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 LINC01297-202ENST00000453395 624 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AP001528.1-201ENST00000499504 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC090541.1-201ENST00000519803 467 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AL034374.2-201ENST00000605281 548 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 AC131649.1-201ENST00000569215 1313 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HOXB1P14653 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms