Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
COL6A2P12110 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.8 ms