Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SFTPCP11686 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SFTPCP11686 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms