Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
U2AF1L5P0DN76 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
U2AF1L5P0DN76 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms