Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM10L2BP0DMW5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SMIM10L2BP0DMW5 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SMIM10L2BP0DMW5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms