Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RGPD2P0DJD1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RGPD2P0DJD1 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms