Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ79

ZNF888, Zinc finger protein 888, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF888P0CJ79 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ZNF888P0CJ79 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms