Protein–RNA interactions for Protein: P0C2W7

CT47B1, Cancer/testis antigen 47B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT47B1P0C2W7 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CT47B1P0C2W7 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
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