Protein–RNA interactions for Protein: P04196

HRG, Histidine-rich glycoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRGP04196 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
HRGP04196 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
HRGP04196 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
HRGP04196 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms