Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSF2P04141 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSF2P04141 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms