Protein–RNA interactions for Protein: O95260

ATE1, Arginyl-tRNA--protein transferase 1, humanhuman

Predictions only

Length 518 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATE1O95260 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
ATE1O95260 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
ATE1O95260 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms