Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
SKAP2O75563 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
SKAP2O75563 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms