Protein–RNA interactions for Protein: O75140

DEPDC5, GATOR complex protein DEPDC5, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC5O75140 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DEPDC5O75140 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC5O75140 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms