Protein–RNA interactions for Protein: O43525

KCNQ3, Potassium voltage-gated channel subfamily KQT member 3, humanhuman

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Length 872 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ3O43525 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
KCNQ3O43525 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
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