Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
LRRTM2O43300 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
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