Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PHF1O43189 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PHF1O43189 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
PHF1O43189 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
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