Protein–RNA interactions for Protein: O14802

POLR3A, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3AO14802 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
POLR3AO14802 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
POLR3AO14802 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms