Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
E2F3O00716 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2F3O00716 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
E2F3O00716 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
E2F3O00716 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
E2F3O00716 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms