Protein–RNA interactions for Protein: O00592

PODXL, Podocalyxin, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXLO00592 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
PODXLO00592 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms