Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCER2I3L3R5 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCER2I3L3R5 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms