Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
KLHL33A6NCF5 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms