Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
A4D1N5 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
A4D1N5 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
A4D1N5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
A4D1N5 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
A4D1N5 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
A4D1N5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
A4D1N5 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 OSTM1-AS1-202ENST00000441184 3334 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 ALDH9A1-201ENST00000354775 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.39□□□□□ -0.59
A4D1N5 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A4D1N5 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A4D1N5 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A4D1N5 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A4D1N5 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
A4D1N5 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
A4D1N5 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms